Возможно ли получение образовательной лицензии для обособленных структурных подразделений ООО?

Здравствуйте, У меня вопрос. Зарегистрировано ООО, образовательная деятельность внесена в дополнительные ОКВЭД. На территории другого региона в двух городах открыты обособленные структурные подразделения. В трех городах двух регионов получены согласования СЭС и все необходимые заключения. ООО находится на УСН. Документы поданы для лицензирования в Отдел лицензирования Министерства образования по месту регистрации ООО. В министерстве отказали лицензировать обособленные подразделения, объяснив, что необходимо открывать регистрировать филиал. Насколько это правомерно? Ведь при открытии филиала мы будем вынуждены платить НДС? Занимаемся допольнительным образованием детей и взрослых.